O ISMAT tem como Responsáveis Máximos um Administrador e um Diretor Científico e Pedagógico

Administrador
Professor Doutor Manuel Damásio

Delegada do Administrador

Maria Ivone Portugal

Diretor Científico e Pedagógico
Professor Doutor Rui Manuel Loureiro

Outros Órgãos Institucionais

Conselho Científico
O Conselho Científico é composto pelo Diretor; pelos Coordenadores dos diferentes Cursos em funcionamento; e por todos os Docentes ou Investigadores habilitados com os graus de doutor.

Conselho Pedagógico
O Conselho Pedagógico é composto pelo Diretor; pelos Coordenadores dos diferentes Cursos em funcionamento; por dois Assistentes de cada Curso que representam, eleitos pelos seus pares; por um Aluno por cada Curso que representa, eleito pelos seus pares.

Conselho Geral
O Conselho Geral é composto por membros natos e por membros designados.

São membros natos o Diretor; o Administrador; os Coordenadores dos diferentes Cursos em funcionamento; o Diretor dos Serviços de Auditoria Pedagógica e Académica, internamente designado por Secretário-Geral; o Diretor da Biblioteca; o Presidente da Mesa da Assembleia Geral da COFAC; o Diretor de Desenvolvimento e Cooperação da COFAC; o Presidente da Associação Académica.

São membros designados: dois Docentes de cada categoria, eleitos pelos seus pares; dois Investigadores eleitos pelos seus pares; dois Alunos representantes de cada curso eleitos pelos seus pares; dois representantes da COFAC; um representante dos trabalhadores não docentes da COFAC.